MULTI-RESIST

Développer des lignées de riz élites multi-résistantes aux maladies en Afrique par édition multiplex du génome.

Établissement coordinateur : IRD

Pilote scientifique : Boris Szurek

PHIM

Durée du projet : 48 mois

Budget total : 1 090 855 €

Montant de l'aide : 499 648€

 

Les maladies du riz causent d’importantes pertes de rendement en Afrique subsaharienne, où la production ne couvre que 60% des besoins de consommation. Quatre maladies majeures, à savoir la bactériose vasculaire du riz (BLB), la bactériose à stries foliaires (BLS), la pyriculariose, et la panachure jaune du riz, sont responsables de 13% des pertes de rendement dans la région. Notre objectif principal est de développer des lignées de riz élites résistantes à plusieurs maladies en Afrique en utilisant des approches innovantes d'édition multiplexe du génome. Ainsi, notre projet constituera une vitrine du potentiel transformateur de cette technologie pour l'amélioration durable des grandes cultures. Ce projet pionnier dans le pyramidage simultané de plusieurs gènes de résistance au sein de variétés élites de riz, offre une stratégie rarement déployée aujourd’hui malgré tout son potentiel pour conférer une résistance durable et à large spectre. Contrairement aux études antérieures réalisées sur des gènes uniques et dans des variétés modèles, nous ambitionnons d’éditer directement une variété élite de riz africaine, la variété Komboka qui est très populaire en Afrique de l’Est, démontrant de ce fait toute la pertinence du projet en termes d’application et potentiel d’impact socio-économique. Le projet est structuré autour de cinq « work packages » (WP). Après la génération des lignées de riz GE et leur caractérisation génétique (WP1), les lignées feront l'objet d'une évaluation rigoureuse en trois phases : évaluation de la croissance, du développement et des traits physiologiques incluant la performance photosynthétique dans des conditions contrôlées pour détecter d'éventuels compromis (WP2), criblage de la résistance aux maladies contre des souches de pathogènes sélectionnées incluant des souches régionales représentatives des quatre maladies cibles dans des conditions contrôlées (WP3), et essais de terrain multi-sites au Kenya évaluant à la fois l'efficacité de la résistance aux maladies et la performance agronomique dans des conditions réelles (WP4). La coordination du projet est rassemblée dans le WP5. Le projet MultiResist fournira une preuve de concept pour créer des lignées élites de riz durablement résistantes, contribuant à la sécurité alimentaire dans les régions vulnérables tout en faisant progresser la transition agroécologique via une moindre dépendance aux intrants. Cette approche novatrice établira un cadre méthodologique et conceptuel pour le développement accéléré de variétés multi résistantes, illustrant comment les technologies d’édition du génome peuvent s'intégrer efficacement aux stratégies de sélection modernes au service d'une agriculture durable.

 

Le projet MULTI-RESIST est en lien avec les axes 1, 2 & 3 du PEPR Sélection Végétale Avancée  : 

Axe 1 : Développement de l’édition des génomes pour l’application à un large panel d’espèces

Axe 2 : Edition des génomes pour accompagner la transition agroécologique 

Axe 3 : Intégration de l’édition des génomes dans les schémas de sélection